在2002年推出的影片《伯恩的身份》票房大热之后，环球公司决定继续将著名作家罗伯特·勒德姆(Robert Ludlum)发表于1980年的同名国际畅销间谍系列小说第二部《伯恩的霸权》(The Bourne Supremacy)搬上银幕。 在经历上一集中的腥风血雨之后，伯恩(马特·达蒙饰)终于找回了自己的身份，他就是CIA特工大卫·韦伯。厌倦厮杀的他本想退出江湖，和女友过着隐秘幽静的生活，但是现实往往不能如他所愿。一次国际政治刺杀时间使他又被卷入了一场谍影重重的政治阴谋中…… 一名某大国的政界要人被职业杀手所刺杀，杀手留下的证据表明他的身份是“杰森·伯恩”，也就是大卫·韦伯以前在CIA的化名。中情局和秘密组织的矛头同样指向了他。上集中与伯恩合作的尼科莱特(茱莉娅·斯蒂尔斯饰)相信伯恩是清白的，但她发现自己也被中情局列入了怀疑的行列。同时，伯恩的女友也神秘失踪。于是，伯恩只有单枪匹马，找到那个在背后嫁祸于他的人，洗清自己的冤屈。可他发现越调查，就越陷入了敌人设下的迷雾之中……...
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