2003年王菲在上海拍戏,李亚鹏飞往上海为王菲设宴庆祝生日,当众示爱。2004年7月王菲和李亚鹏恋情曝光。
2005年7月,结婚生子。2005年,王菲、李亚鹏在上海投资酒吧“VIPROOM”。2006年5月,王菲产下小女儿,取名李嫣。7月两人带女儿去美国治疗兔唇,之后共同成立“嫣然基金会”,关注唇腭裂患儿。在12月26日的“嫣然慈善基金答谢会”上募集到1200万善款。2010年,李亚鹏拍摄《将爱情进行到底》,王菲力挺老公献唱主题曲《因为爱情》。
2013年9月13日,王菲李亚鹏在乌鲁木齐离婚,发布微博对外宣布离婚。微博被转发评论近百万条,创造微博历史之最。
王菲与窦唯离婚后,童童一直跟着母亲王菲,与李亚鹏再婚以来,窦靖童也一直跟继父李亚鹏、妹妹李嫣一起生活。
2006年5月27日,北京协和医院,王菲产下第二个女儿,取名李嫣。李嫣出生时是兔唇婴儿,王菲当时为了让女儿接受治疗而跟丈夫带嫣儿到美国做手术。八月,李亚鹏在博客上承认女儿为天生腭裂婴儿,为了让更多兔唇婴儿得到帮助,王菲与李亚鹏成立“嫣然天使基金”,久休的王菲亲自填了一首词:《爱笑的天使》,并找来陈辉阳谱曲,赠与女儿,并将其作为基金启动晚会的主题歌。
王菲和李亚鹏虽然已经宣布离婚,但在2013年9月19日中秋佳节当晚19时许,两人依然一起带着女儿李嫣来到北京某餐馆,与亲友举行团圆大聚餐。李亚鹏提前预订包间,专门为王菲点上了爱吃的菜。
王菲庆李嫣8岁生日晒跳舞照成国民岳母。
2014年5月27日是王菲与李亚鹏的女儿李嫣8岁的生日,王菲在微博上晒出了一张李嫣正在学跳舞的照片,并与李亚鹏一起为女儿举行了庆生会