第一季《雷伊传说》
宇宙能源探索飞船赛尔号即将起飞,起飞前发布招员公告,一位叫赛小息的机器人在登上赛尔号后结识了精灵小米,并与阿铁打和卡璐璐组成探险小队。赛尔号寻找传说中的雷伊,小队在此期间游历星球,帮助了许多精灵。最后在赫尔卡星,雷伊送了他们一块无尽能源,但这块无尽能源却被海盗迪恩毁了。雷伊告诉小队在谱尼那里还有一块无尽能源,小队就踏上了寻找谱尼的路程。
第二季《圣者逆袭》
小队从奈尼芬多那里得知谱尼在卡兰星系的宇宙深渊,找到谱尼并解除了谱尼的封印,因打不过谱尼而逃到哈莫星,结识了哈莫雷特。之后谱尼追到赛尔太空站,好在在众人的努力下成功打败了谱尼,获得了第二块无尽能源,这块无尽能源却被布莱克抢走。小队在寻找布莱克的途中结识了卡修斯,最后,卡修斯和无尽能源都被布莱克带走。
第三季《光明的救赎》
小队继续寻找布莱克,和精灵马力一起为麦兹星寻求光明,之后从木木大祭司那里知道了以威斯克为首的邪灵组织给布莱克的悲惨往事。最后在格雷斯星上,卡修斯和布莱克合力击败了威斯克,威斯克化成一滩黑水逃走。为救昏迷的雷伊四人,小队踏上了寻找始祖灵兽的路程。
第四季《战神风云决》
小队找到了始祖灵兽,并请他救治雷伊四人。由于布莱克之前被威斯克强迫吸收的黑暗能量过于强大,无尽能源为救他而用掉了。之后他们得知能实现愿望的阿瑞斯水晶的传说。雷伊在赫尔卡星的战神岛得到水晶后,帮小队许愿找回了那块救布莱克用掉的无尽能源。赛尔号在返回路上遭遇恶灵三巨头袭击,最后降落在巴斯星上。
第五季《猎天困兽》
小队在巴斯星上遇到帕罗狄亚,在化解他与哈莫雷特的恩怨后,恶灵三巨头抢走了许愿找回的无尽能源,并用其解除了恶灵兽的封印。米瑞斯从恶灵兽身上抢回了无尽能源,斯塔奥用这块无尽能源封印了恶灵兽。小队离开后遇到雷伊的师兄艾里克,得知艾里克已将一块无尽能源赠予了神兽麒麟,就踏上了寻找麒麟的路程。
第六季《苍穹烈火》
小队为寻找麒麟,来到了帕索尔星。在化解麒麟与当地居民之间的矛盾后,麒麟告诉小队,去找到巨石星的卡图冈之门,无尽能源才会出现。小队就踏上了寻找卡图冈之门的路程。后面就在巨石星找卡图冈之门。
第七季《宇宙之眼》
在卡图冈之门处,麒麟拿出艾里克给他的无尽能源,小队选择用来恢复巨石星的生机。原本在卡图冈之门上的无尽能源被吉约毁后,尤尼卡送给他们一块海盗芯片,他们破密后得知一个有着无尽能源的蓝色天体“宇宙之眼”。在集齐三圣石,查看了宇宙之眼的航线后,小队里只有卡璐璐记住了航线。小队随后返回赛尔号。
第八季《幻梦战记》
小队在返回途中遇到海盗吉约,卡璐璐被其打成重伤昏迷。小队回到赛尔号后,小琳暂时替代了卡璐璐的位置。赛尔号前往第一站雅丹星云洞,却被幻梦结界挡在入口,小队在幻象星请赫尔墨斯打开结界让赛尔号进去了。受到基因改造的谱尼接受索伦森的召唤,来到雅丹星云洞的云霄灵池,开始了与索伦森的故事线。最后,索伦森被击败逃走并遇到海盗迪恩,卡璐璐被圣物树之灵治好并回归小队,小琳返回地球,谱尼去寻找索伦森,赛尔号启程离开雅丹星云洞。
第九季《霹雳九重天》
由于苏醒后的卡璐璐记忆芯片出了问题,赛尔号误入一个上下完全颠倒的逆世界。与此同时,谱尼与索伦森的故事继续展开。赛尔号离开逆世界后进入第二站飞龙座,离开飞龙座后朝第三站巨熊座进发。
第十季《冰封要塞》
赛尔号被寒冰结界挡在巨熊座入口,小队到冰雪星找到雪熊加卡,请他打开结界让赛尔号进去了。最后他们从巨熊座的磁石中得知,要到达宇宙之眼需要集齐七颗宝石。赛尔号为寻找水能石,前往水仙座。
第十一季《裂空沧海》
赛尔号到水仙座借得水能石后,降落在长蛰星。另一边,迪恩制造出格莱奥和艾辛格两位暗联成员。艾辛格从赛尔号上救走吉约和煞德罗,带着他们在返航海盗基地的路上,格莱奥在赛尔号上找水能石遇卡修斯阻拦,双方即将展开对决。