1985年初夏,巩俐再次参加了全国统一考试,但她的高考分数与艺术院校录取标准相差11分。中戏招生组的老师们都为之惋惜,不过他们没有轻易在巩俐的名字上打叉。招生组郑重其事地写了一份报告呈交上级主管部门:文化部艺术教育司,要求对录取巩俐予以特别批准。文化部艺术教育司的批复很快下达,批准了中戏的要求。同年,巩俐走入了中央戏剧学院表演系的大门。
1990年,巩俐与张艺谋继续合作,主演其第三部电影《菊豆》,影片获得第43届戛纳国际电影节布努埃尔特别奖,并提名第63届奥斯卡金像奖最佳外语片,成为首部提名该奖的华语影片;巩俐本人凭借此片获得保加利亚瓦尔纳市国际电影节最佳女演员奖。