1995年考入江西艺术职业学院95级话剧班,受到了三年正规的“学院派”话剧表演基本训练,还结识了导他走向正途的恩师邓学东老师。 1998年考上中央戏剧学院表演系98级本科班,来到北京。每天清晨在中戏的校园跑步和练台词,训练标准的台词发音。 大学二年级起,邓超喜欢上演话剧,不但在学校的表演作业里训练演出大量的角色,传统正剧他能演,创新喜剧他也能演,此外他还是班上人缘很好的“开心果”。2001年,大三的邓超与同学合作演出贺岁的话剧《翠花上酸菜》成为他学生时代的成名作。上大学时,他还被中戏的同学称为“戏疯子”。 2002年,邓超在中央戏剧学院毕业,获得大学学士学位。2000年,首次拍摄电视剧《黄沙下面是沃土》,饰演一个反派角色。该剧在大二拍摄,在央视八套播出。2001年,成为了一名话剧演员 ,演出毕业话剧《翠花上酸菜》,在当时北京话剧舞台催生出五六个“翠花”系列作品(包括“翠花”系列、“麻花”系列、“韭菜花” 系列)。同年主演英达导演的《欢乐青春》,剧集因为被美国时代华纳集团总裁买断版权,而被国内禁播,使此后的邓超走上和喜剧迥然不同的正剧之路。 2002年,邓超拍摄首部担任主角的电视剧《少年天子》,饰演了顺治帝福临,剧集由编剧刘恒编导,原著获第三届茅盾文学奖,该剧的热播也让邓超被观众所熟知。这部历史电视剧也让邓超被媒体称为“皇帝专业户”。 同年,毕业成为中国国家话剧院演员,从此落户北京。演出《少年天子》后也签约了其出品方广州东方明珠文化传播有限公司,合约期至2007年。
2007年,邓超与周迅、张涵予、王宝强合作主演曹保平导演的爱情文艺片《李米的猜想》,饰演女主角周迅苦苦追寻的男主角方文,并因此片获得第12届电影表演艺术学会奖“金凤凰奖”, 该片也获得第二届铁象电影大赏十佳电影、上海影评人奖十佳电影等奖项,并参展了韩国、英国、瑞士、塞尔维亚、美国、意大利、尼日利亚、西班牙等国际电影节;2012年该片被驻日本大阪总领事馆选为公映播放的中国电影。