邓紫棋小学就读中华基督教会协和小学,同时为校内诗歌班成员。中学就读真光女书院,课余时亦曾参与过体操。高中时期不断参加各种歌唱比赛,曾一年内嬴得5个比赛冠军。
2006年,14岁的邓紫棋参加Spice It Up学界联校歌唱比赛,夺得比赛冠军,被经理人张丹(Tan)邀请签约蜂鸟音乐,蜂鸟音乐一共只有十几位员工,邓紫棋从出道起就一直在微博等自媒体上记录成长并与歌迷交流。两年后正式成为歌手,同年,在Westlife的亚洲巡回演唱会(Westlife's Face to Face Asia Tour)中的记者会中担任表演嘉宾。2008年入读香港演艺学院,主修声学,因工作量日渐增多,2009年上半年放弃香港演艺学院的声学课程。
2008年10月,16岁的邓紫棋推出个人首张EP《G.E.M.》,碟内收录3首广东歌与2首国语歌,还收录了当年的参赛歌曲《Sleeping Beauty》的中文版《睡公主》;夺得2008年度叱咤乐坛流行榜颁奖典礼“叱咤乐坛生力军女歌手金奖”。